Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms