Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1P21675 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF1P21675 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF1P21675 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF1P21675 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF1P21675 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1P21675 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1P21675 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1P21675 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms