Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms