Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB3BP20337 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms