Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPI1P17947 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPI1P17947 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms