Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms