Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms