Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A1P13866 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms