Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL2P13500 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL2P13500 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL2P13500 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms