Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms