Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms