Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PF4V1P10720 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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