Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GLI4P10075 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GLI4P10075 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms