Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L5P0DN76 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms