Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIL1P09327 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIL1P09327 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIL1P09327 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms