Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEFMP07197 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFMP07197 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFMP07197 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFMP07197 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFMP07197 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFMP07197 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFMP07197 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFMP07197 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEFMP07197 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEFMP07197 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEFMP07197 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms