Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P02748 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P02748 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P02748 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P02748 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P02748 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P02748 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P02748 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P02748 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P02748 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P02748 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P02748 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P02748 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms