Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA2P01563 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA2P01563 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms