Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24BO95487 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms