Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF254O75437 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms