Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPAG9O60271 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPAG9O60271 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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