Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms