Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CREB3O43889 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CREB3O43889 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CREB3O43889 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms