Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VGFO15240 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VGFO15240 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VGFO15240 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
VGFO15240 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
VGFO15240 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VGFO15240 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VGFO15240 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
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