Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD28O15084 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms