Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE40O14503 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms