Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms