Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DFFAO00273 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DFFAO00273 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DFFAO00273 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DFFAO00273 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms