Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3QRK9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QRK9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms