Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms