Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L12C9JPN9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms