Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DSR2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DSR2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DSR2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DSR2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DSR2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DSR2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DSR2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DSR2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DSR2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DSR2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DSR2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DSR2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DSR2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DSR2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DSR2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DSR2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DSR2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms