Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC69A6NI79 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC69A6NI79 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms