Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms