Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms