Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2APQ9Y5K6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms