Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.58■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC8Q9Y2L5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms