Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINLQ9Y2I6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms