Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms