Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC5Q9UQL6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC5Q9UQL6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms