Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms