Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CEP164Q9UPV0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CEP164Q9UPV0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CEP164Q9UPV0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CEP164Q9UPV0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CEP164Q9UPV0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CEP164Q9UPV0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms