Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms