Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms