Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA1Q9UJY5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms