Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms