Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTNAP2Q9UHC6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTNAP2Q9UHC6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTNAP2Q9UHC6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTNAP2Q9UHC6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTNAP2Q9UHC6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTNAP2Q9UHC6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms