Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFIP11Q9UBB9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms