Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms