Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ABI3Q9P2A4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms